Entonces, si hay chispa y hay impulsos de inyección, se trata de un problema de combustible, salvo que el sistema se haya ido de punto, cosa poco probable puesto que entiendo que simplemente se ha cambiado la batería.
Me resulta muy extraño que surja ese problema (el del combustible) ya que, en casos parecidos, casi siempre se trata de que alguna de las masas, bien de la unión de la batería con el chasis o con el motor puede fallar al mover el cableado.
Comprueba que llega combustible al conducto común de inyectores.
En fin, no se me ocurre nada más.